COLEGIO JESUITAS SIGLO XVII
Pedro Cabrera
1625-1626
Pedro Egurrola
1626-1630
Juan De Figueroa
1631-1632
Jorge Manrique
1633
Francisco Ríos De Soto
1634
Luis Gómez
1635-1636
Luis Suárez
1636-1637
José Gandia
1638-1640
Luis Sosa
1641
José Gandia
1642-1645
Alfonso Farfán
1646
Luis Suárez
1647-1652
Diego Osorio
1653-1654
José Gandia
1655-1657
Agustín Guzmán
1658-1659
Nicolás De Barreda
1660-1663
Agustín de Guzmán
1664
Juan Pascual
1665-1669
Juan Manuel De Gamboa
1670
Eugenio De Loza
1671-1673
Francisco Montero
1674
Francisco Javier De Faría
1675-1679
Domingo De Figueroa
1680
Juan De Roble
1681-1683
Juan Manuel De Gamboa
1684-1685
Felipe De Hinestrosa
1686-1688
José Díaz
1689-1692
Bernardo Rolandegui
1693-1695
Agustín de Roa
1696
Domingo Miguel
1697-1698
Diego Felipe De Mora
1699-1703

SIGLO XVIII

Nicolás Azoca
1704-1706
Antonio Gutiérrez
1707
Martín Lezama
1708-1710
Miguel De Rosell
1711-1713
Alonso Calvo
1714-1715
Ambrosio De Villacasín
1716
Alonso Calvo
1717-1718
Antonio De Mora
1719-1721
Francisco Ortíz
1722-1723
Pedro Sarmiento
1724
Antonio Casín
1725
Antonio De Paredes
1726-1728
José Antonio Navarrete
1729
Pedro León De Molina
1730-1732
Francisco Antonio Navarrete
1733-1735
José De Ascaní
1736-1738
Francisco Antonio Navarrete
1739
José Redona
1740-1747
Agustín de Carta
1748-1750
Antonio De Paredes
1751-1753
Ignacio Rondero
1754-1757
Juan José Ruiz De Castañeda
1758-1760
Salvador De La Candara
1761
Francisco Mariano Canvhez
1762-1763
Josquín José Isauzqui
1764
Diego Verdugo
1765
Andrés Lucena
1766
Diego José Abad
1767
COLEGIO CIVIL DEL ESTADO
Prospero C. Vega
1869
Nicolás Campa
1869-1875
Benigno Frías
1876
Mariano Reyes
1880
Prospero C. Vega
1880-1883
Adolfo De La Isla
1893-1911
Salvador Alvarez
1911
José Antonio Septien
1911-1913
Luis M. Vega
1914
José Islas
1914-1917
Luis M. Vega
1917-1927
Luis F. Pérez
1928-1929
Leopoldo Aguilar
1929-1930
Luis M. Vega
1930-1931
Hazael Monter
1931-1932
Leopoldo Martínez Cosio
1932
REAPERTURA DEL COLEGIO CIVIL
Ramón G. Bonfil
1936-1939
Luis M. Vega
1939-1943
Antonio Pérez Alcocer
1943-1949
Francisco Rodríguez Aguillón
1949-1950
Juan Alvarez Torres
1950
Fernando Díaz Ramírez
1950
RECTORES DE LA UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE QUERÉTARO
Fernando Díaz Ramírez
1951-1958-1963
José Alcocer Pozo
1958
Alberto Macedo Rivas
1964-1965
Hugo Gutiérrez Vega
1966-1967
Enrique Rabell Trejo
1967-1968
Salvador Septien Barron
1968-1970
Agapito Pozo Balbas
1970-1971
José Guadalupe Ramírez Alvarez
1971-1976
Enrique Rabell Fernández
1976-1979
Mariano Palacios Alcocer
1979-1982
Braulio Guerra Malo
1982-1988
Jesús Pérez Hermosillo
1988-1994
José Alfredo Zepeda Garrido
1994-2000
Dolores Cabrera Muñoz
2000-2006   
Raúl Iturralde Olvera
2006-