La Maestría en Gestión Integrada de Cuencas (MAGIC) inició sus actividades el 19 de agosto del 2003. El programa surge del trabajo conjunto de más de cinco años de un núcleo de profesores de cinco facultades, que constituían un grupo con aspiraciones interdisciplinarias para el manejo de cuencas, en parte por decisión conjunta de comunicar lo que habíamos logrado hasta el momento y en parte, derivado de fructíferas discusiones en ambientes informales y formales con Axel Dourojeanni. También fue un momento coyuntural coincidente con la formulación de las nuevas Leyes Federales de: Aguas Nacionales, Desarrollo Forestal Sustentable y Desarrollo Rural Sustentable, así como la orientación de secretarías de estado como la SEMARNAT y la SAGARPA hacia el manejo de los recursos naturales y la promoción del desarrollo rural basado en cuencas como unidades territoriales delimitadas de manera natural y como posibles áreas para un desarrollo con una visión integrada.

Hoy en día es un programa con orientación profesional, de ámbito intra e inter-institucional con la participación de seis facultades (Ciencias Naturales, Ingeniería, Psicología, Filosofía, Ciencias Políticas y Sociales y Química) y diferentes dependencias estatales y federales que apoyan a través de proyectos de vinculación y personal docente, dentro de un planteamiento metodológico interdisciplinario. Es un programa científico-práctico que responde a los objetivos estratégicos educativos de carácter nacional, estatal e institucional de:

• Establecer programas educativos innovadores
• Optimizar los recursos humanos y de infraestructura institucionales
• Promover una mayor vinculación del quehacer universitario con las necesidades de formación de recursos humanos y solución de necesidades de los sectores público y social.
• Consolidar procesos de inter-disciplinariedad que sean socialmente pertinentes.